一间平凡无奇的咖啡店，老板在打烊后回到二楼的住所，放松之际，突然被电脑萤幕中的自己给叫住，对方声称是来自两分钟后的自己。原来他的咖啡店和住所之间有两分钟的“时差”。
在空地上，小夫（肝付兼太 配音）向大家炫耀现在最畅销的神秘火车的车票，胖虎（立壁和也 配音）和静香（野村道子 配音）恳求小夫也带他们去。这时，大雄（小原乃梨子 配音）急匆匆跑了过来，哆啦A梦（大山信代 配音）已经三天没回家，小夫和胖虎在一旁幸灾乐祸的笑着。晚上，哆啦A梦回来了，原来这三天他跑到了22世纪去买银河列车的车票。第二天晚上，银河列车在后山停站了，大雄和哆啦A梦开始了他们的银河之旅，车长（伊仓一恵 配音）总是笑嘻嘻，很有礼貌。另一边，神秘的生命体降落在了后山，是来自宇宙的寄居物，寄居物将自己附在人类的身体上，来操纵人的大脑，他们的目的是将整个地球毁灭掉。 在车上奇奇怪怪的事情发生不断，大雄在车厢外看到了一个忍者，小夫说看见了海盗，胖虎则看见了恐龙。哆啦A梦告诉大雄他们出现了一伙“神秘黑色影团”。遭到黑色影团的袭击后，列车在一颗行星上停下了，而冒险这才刚刚开始……
2032年的洛杉矶。 一名年轻女子醒来时没有任何记忆，并且身怀致命绝技。 解开她秘密的唯一线索是一个上了锁的数据设备和一个黑莲纹身。 拨开迷雾，她必须追查那些对该她残酷而血腥的过往有个交代的人，以找出她身份迷失的真相。
